氨氮是較早做為水質監測的一項基本指標值。為何將氨氮做為評定水體優劣的規范？由于水體中氨氮多少與水體水體富營養化呈顯著的正關聯性。氨氮高的水體，水體富營養化水平高。大家一般檢驗的氨氮是水體中銨根離子（NH4+）和非離子氨（NH3）的統稱。

水體中的氮關鍵來自投喂的飼料

　　現在標準飼料的關鍵指標值之一便是蛋白質含量高低。而飼料中的蛋白質被魚類、蝦類攝食后，僅有一小部分會被消化，絕大多數會代謝進到水體。這一部分蛋白在病菌的功效下，會被溶解為無機物態的氨態氮和硝態氮。這兩部分的氮元素最后被藻類植物和微生物菌種使用再次進到物質循環中。

氨氮毒性

　　氨氮在水體中會以上面的平衡關聯進行轉換。銨離子的毒性較差，然而離子氨則具備毒性。非離子氨很容易通過細胞質進入體內，造成血夜中高鐵血紅蛋白濃度上升，血夜載氧濃度降低，從而呈現出缺氧的癥狀。與此同時非離子氨也會對魚類、蝦類的中樞神經系統導致毀壞。即便 是較低濃度的的氨氮，長期性觸碰也會危害鰓機構，造成鰓小塊彎折、黏連或結合。